Primogenito del duca Giovanni de Borja, nasce a Gandia (Valencia, Spagna) il 28 ottobre 1510. Entra nella Compagnia di Gesù a Gandia il 2 giugno 1546, prendendo i 4 voti il 1 febbraio 1548 (Gandia). Ricopre importanti incarichi, tra cui quello di Commissario dell'Ordine in Spagna (1554-1561) e delle province d'Italia (1562-1564) e Assistente di Spagna e Portogallo (1564). Nel 1565 viene eletto III Preposito Generale della Compagnia, succedendo a Diego Lainez. Fonda numerosi collegi e promuove le missioni. Muore a Roma il 30 settembre 1572. Beatificato da papa Urbano VIII il 23 novembre 1624, viene dichiarato santo da papa Clemente IX nel 1671.

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